Tie pārstāv divu vai vairāku aminoskābju savienojumu, savienojot oriģinālu un peptīdus. Produktos un olbaltumvielās šīs saites ir saistītas ar peptīdu saitēm un karboksilgrupas reakcijas ar citas aminogrupu rezultātu, izslēdzot ūdens molekulu.
Peptīda saite (-CO-NH) parasti tiek attēlots kā vienkāršās saites. Tomēr bez tam ir vairākas pazīmes, kas aptuveni atbilst dubultai saitei. Tā kā slāpeklis ir mazāk elektronegatīvs nekā skābeklis, CO saitei ir 60% dubultās saites raksturs, bet CN saite ir 40%. Tāpēc peptīdu saites CO un NC saitēm ir starpposma īpašības starp vienreizējo saiti un dubulto saiti. Faktiski CO un CN saitēs izmērītie starpatomu attālumi ir starpnieki starp atsevišķajiem savienojumiem un dubulto saiti. Šo atomu izkārtojumu stabilizē rezonanse, tā ka seši atomi, kas iesaistīti peptīdu saites veidošanā, atrodas vienā plaknē.
Citas svarīgas rezonanses sekas ir tādas, ka tā palielina peptīdu saites polaritāti un izveido dipola momentu (labais skaitlis iepriekš redzamajā tabulā). Šī iemesla dēļ katra peptīdu saite var piedalīties divās ūdeņraža saitēs. Vienā no tām -NH- grupa darbojas kā ūdeņraža donors, bet otrā -CO- grupa darbojas kā ūdeņraža receptors. Šis īpašums ievērojami veicina olbaltumvielu trīsdimensiju locīšanu, kā mēs to redzēsim vēlāk.
Daļējs raksturs no dubultsaiti novērš brīvu griešanos saites, kas savieno C un N atomus, kas ir peptīda saites. Šis divkāršās saites stingrums ierobežo peptīdu konformācijas iespējas. Ir divas iespējamās konfigurācijas:
- Cis konfigurācija: abi Ca ir dubultās saites vienā un tajā pašā pusē.
- Trans konfigurācija: abi Ca ir divkāršās saites atšķirīgā pusē.
Jāatzīmē, ka kopumā peptīdu saite tiek attēlota kā vienota saite. Jebkurā gadījumā tam ir vairākas īpašības, kas padara to tuvu dubultai saitei. Tāpēc speciālisti parasti min, ka peptīdu saitei piemīt īpašības, kas to novieto pusceļā starp vienreizējo saiti un dubulto saiti.
