Ekosistēmās mijiedarbība var rasties starp vienas sugas elementiem, uzturot to pašu diētu vai kopīgi izmantojot to pašu vidi, šāda veida mijiedarbību sauc par intraspecifisku. Kaut arī attiecības pastāv starp divām dažādām sugām, to sauc par starpsugu un tā ir tā, kas rodas starp augiem un kukaiņiem.
Intraspecifiska mijiedarbība (vienas sugas elementi) var būt īslaicīga vai nenoteikta, šāda veida mijiedarbība var būt labvēlīga, ja starp iesaistītajiem organismiem pastāv sadarbība, kuras mērķis ir pārtikas iegūšana, un sugas aizsardzība pret vides apdraudējumiem (auksts, karstums, plēsēji, cita starpā).
Savukārt starpsugu mijiedarbība (dažādu sugu elementi) ir svarīga, jo tā veicina sistēmas strukturēšanu.
Līdzīgi ekosistēmā ir arī citi mijiedarbības veidi, daži no tiem ir:
Neitralisms: tas ir tas, kurš radies starp divām sugām, to raksturo tāpēc, ka neviena no abām pusēm negūst labumu vai netiek kaitēta.
Savstarpīgums: šī mijiedarbība ļauj dažādu sugu indivīdiem gūt labumu un uzlabot viņu bioloģiskās spējas.
Simbioze: tā ir tā, kuras izcelsme starp divām vai vairākām sugām ir obligāta un kurā ikviens gūst labumu no savas vitālās attīstības. Simbiozē iesaistītos organismus sauc par simbiontiem.
Atvieglojums: ir tāds, kurā tiek iecienīta vismaz viena no sugām.
Plēsība: tā ir tāda, kur viena suga noķer un barojas ar otru. Indivīds var būt vairāku sugu plēsējs un būt citu upuris. Šāda veida plēsēju un ekosistēmas mijiedarbība ir svarīga, jo plēsēji, kontrolējot sugas subjektu skaitu, aizsargā ekosistēmu no nelīdzsvarotības. Piemēram, ērglis barojas ar pelēm un šie, savukārt, ar dažiem augiem. Ja šis plēsējs izzustu, grauzēju populāciju nevarētu samazināt, un tas samazinātu augu populāciju.
Parazītisms: šāda veida mijiedarbībā viena suga ir labvēlīga, bet otra - nē; parasti parazīts ir mazāks par saimnieku. Tas ir process, ko raksturo fakts, ka suga palielina spēju izdzīvot, izmantojot citas sugas, lai apmierinātu savas vajadzības.