Tika dota mikroskopa izcelsme, ka senie cilvēki zināja, ka, aplūkojot izliektus spoguļus vai stikla sfēras ar ūdeni, mazās lietas ir redzamas ar palielinājumu. Tad septiņpadsmitā gadsimta pirmās desmitgades sāka veikt testus ar lēcām, lai iegūtu lielāku objektu palielinājumu. Tādēļ to pamatā bija pirmais instruments, kas izgatavots ar objektīviem, kam bija lieli panākumi, " teleskops ", ko Galileo pirmo reizi izmantoja astronomiskos nolūkos 1609. gadā.
20. gadsimta sākumā tā ražošana tika koncentrēta galvenokārt Vācijā, un nākamajos gados tika izstrādātas fāžu kontrasts, fluorescence, hologrāfija, traucējumi, rentgenstari, ultravioletā gaisma, metodes ar elektroniem un protoniem. Kvantifikācijai, kvantifikācijai un trīsdimensiju analīzei tika izstrādāti arī datorizēti mikroskopi, šie instrumenti atvēra daudzus laukus mikroskopijas jomā. Kopš 1660. gada līdz mūsdienām optiskais mikroskops ir bijis galvenais pīlārs neredzamo izpētei. Lai gan tā izšķirtspēja laika gaitā palielinājās, uzlabojoties lēcu kvalitātei, kā arī palielināšanas spēkam.
In 1930 mikroskopisku pasaule tika paplašināta, izveidojot elektronu mikroskopu, kuru galvenā atšķirība no optiskā mikroskopa, ir pieaugums par 1000 reizes vairāk palielinājuma posmā no novēroto materiāla, kopā ar labāku izšķirtspēju jaudu radot labāku definīciju un palielinājumu, kas mikroskopiskā pasaule.
Ir divu veidu pamata elektronu mikroskopi, abi tika izgudroti vienlaikus, bet tie pilda dažādas funkcijas, piemēram:
- Pārraides elektronu mikroskops (MET): tas ir atbildīgs par elektronu projicēšanu caur plānu novērojamā materiāla vai audu slāni, atspoguļojot attēlu fosforestējošā ekrānā.
- Skenējošais elektronu mikroskops (SEM): Tas rada attēlu, kas rada trīs dimensiju iespaidu. Šajā mikroskopā tiek izmantoti trīs vai divi punkti, kur nonāk parauga elektroni, kas skenē novērojamā parauga virsmu.
Lielākā daļa elektronu mikroskopijas pionieru bioloģijā joprojām ir dzīvi, un vissvarīgākie ir: Alberts Klods, Earnests Fullams, Dons Fosets, Čārlzs Leblonds, Džons Lufts, Daniels Pease, Kīts Porters un Džordžs Palāde.